ارزیابی پرایمرها قبل از سنتز آنها
2- Standard Primers
تکثیر آمپلی کون مورد نظر بدون هیچ حذف و اضافه ای
تشخیص ویروس و باکتری
3- Degenerate Primers
شناسایی توالی نوکلئوتیدی ساختارهای کدکننده پروتئین ها و پپتیدها
4- Inverse Primers
شناسایی موقعیت insert ژنومی یا سکانس شناخته شده ای در ژنوم
مطالعه متاژنوم
5- cDNA Primers or RT-Specific Primers
شناسایی ویروس های RNAدار
تعیین مقدار ویروس موجود در بدن موجود زنده
بررسی سطح بیان ژنها
6- Cloning Specific primers
آماده سازی insertهابرای وارد نمودن در وکتور مناسب
7- Linker Primers
تکثیر توالی های شناسایی نشده
آماده سازی توالی های شناسایی نشده برای توالی یابی
8- Assembly Primers
سنتز توالی های طویل DNA
طراحی و تولید بیوسنسورها
9- Asymmetric Primers
توالی یابی
ساخت پروب
آپتامر
10- Multiplex Primers
تکثیر و شناسایی توالی های متعدد با انجام یک واکنش
11- MLPA Primers
تکثیر و شناسایی توالی های متعدد با یک جفت پرایمر با انجام یک یا چند واکنش
12- Nested Primers
تکثیر اختصاصی تر آمپلی کون نسبت به نوع استاندارد
کاهش زمینه نامطلوب تکثیر غیراختصاصی DNA
افزایش مقادیر کم الگو
13- SOEing Primers
اتصال اگزانها به هم و خارج سازی اینترانها
ایجاد ساختارهای کایمریک
14- پرایمرهای ARMS
شناسایی جهش یا بیماری ژنتیکی ناشی از تغییر توالی نوکلئوتیدی
تعیین نوع SNP
15- پرایمرهای ADLP
شناسایی جهش یا بیماری ژنتیکی ناشی از تغییر توالی نوکلئوتیدی
تعیین نوع SNP
16- پرایمرهای Dial-out
بازیابی مولکولهای DNA از کتابخانه DNA
17- پرایمرهای Intersequence
انگشت نگاری DNA
ارزیابی هوموزیگوت بودن یا هترزیگوت بودن
18- پرایمرهای SOEing
اتصال اگزانها به هم و خارج سازی اینترانها
ایجاد ساختارهای کایمریک
19- پرایمرهای BSP
شناسایی پروموترها
تعیین پروموتر بودن یا نبودن یک توالی
20- پرایمرهای MSP
شناسایی پروموترها
تعیین پروموتر بودن یا نبودن یک توالی
21- پرایمرهای Mini
تکثیر نواحی Conserved یا حفاظت شده DNA
22- پرایمرهای Solid
بررسی بیان ژن
23- پرایمرهای Genome Replication
افزایش تعداد نسخه های ژنوم
24- پرایمرهای Plasmid Replication
DSO-Nick
افزایش تعداد نسخه های پلاسمید